Определение коэффициента самодиффузии воды в пакете Gromacs

Abstract

Проведены молекулярно-динамическое моделирование температурных зависимостей коэффициента самодиффузии воды вблизи критической области при помощи пакета Gromacs с использованием трехточечного межчастичного SPC-потенциала и сравнение результатов моделирования с опытными данными. Показано, что выбранная методика позволяет обеспечить хорошее согласие результатов моделирования с данными других авторов и эксперимента. Показано, что температурная зависимость коэффициента самодиффузии в критической области одинаково хорошо аппроксимируется как кривыми типа Аррениуса, так и уравнением Коэна-Турнбулла. We performed the molecular dynamics simulation of the temperature dependence of self-diffusion coefficient of water in the supercritical area by means of Gromacs software using three-point interparticle SPC-potential. Simulation results were compared with experimental data, it is shown that the chosen method ensures good agreement of simulation results with those of other authors and experimental data. It is shown that the temperature dependence of the self-diffusion coefficient in the supercritical area is equally well approximated with Arrhenius type curves and the Cohen-Turnbull equation.